Речной вокзал Томска находится в центре города, неподалеку от площади Ленина. Отсюда быстрее и дешевле, чем на автобусах, добираться до близлежащих поселков. От речного порта Томска до Красного Яра можно добраться на теплоходах Заря и Ракета, а теплоход Метеор ежедневно направляется в сторону поселков, находящихся к северу от Томска.

В выходные дни в летний период осуществляются теплоходные прогулки. Также осуществляется бесплатная доставка пассажиров с речного вокзала на пляж о. Семейкин.