НИИ онкологии СО РАМН в Томске является единственным институтом этого профиля на территории Сибири и Дальнего Востока. Институт возглавляет работу проблемной комиссии по онкологии межведомственного научного Совета по медицинским проблемам Сибири и Дальнего Востока, осуществляет научно-методическое руководство онкологическими учреждениями региона по вопросам клинической онкологии и внедрения научных достижений в практику здравоохранения.

С 1994 года институт онкологии является членом Европейской организации противораковых институтов (О Е С I). На базе института работает ординатура по специальностям: онкология, рентгенология и радиология, аспирантура по специальностям: 14.01.12 «Онкология», 14.01.13 «Лучевая диагностика и лучевая терапия». Функционирует диссертационный совет по защите докторских и кандидатских диссертаций по специальности 14.01.12 «Онкология» (медицинские науки).

Основные научные направления:

• Проведение фундаментальных исследований по изучению закономерностей распространения и механизмов патогенеза злокачественных новообразований на территории Сибири и Дальнего Востока, выявление эндогенных и экзогенных этиологических факторов и их комплексов с целью разработки программ по ранней диагностике, профилактике и совершенствованию организации онкологической помощи населению региона.
• Изучение систем жизнеобеспечения организма и молекулярно-генетических характеристик опухоли, отражающих механизмы канцерогенеза и опухолевой прогрессии, для формирования групп повышенного онкологического риска, ранней диагностики и прогноза заболевания с целью проведения своевременной и адекватной терапии.
• Разработка новых эффективных схем комбинированной терапии онкологических больных на основе использования высокотехнологичных подходов, совершенствования режимов адьювантной терапии, патогенетически обоснованного применения новых химиопрепаратов и модификаторов цитостатической терапии, совершенствования методов реконструктивно-пластических и органно-сохранных оперативных вмешательств и подходов по проведению реабилитационных мероприятий.

Институт располагает экспериментальным и клиническим отделами, в состав которых входят 14 научных подразделений, службой научно-медицинской информации, клиникой на 220 коек. Здесь работают 500 сотрудников, в том числе 86 научных работников, 48 врачей. Ученую степень доктора наук имеют 30 сотрудников, кандидата наук — 66.