На Московском тракте "белая" мечеть была построена в 1915 г. по плану, составленному губернским инженером-архитектором А.И. Лангером. Мечеть принадлежала татарской мусульманской общине вплоть до 30-х годов, затем, после насильственного разгона общины, была передана правлению артели Культспорт. В этот же период были разобраны минарет и купол - гумбаз.

Последним хозяином здания с 1960-х годов был один из цехов томской карандашной фабрики. 26 апреля 1990 г. мечеть была возвращена мусульманам.

В настоящее время она восстановлена, и ежедневно Московский тракт и прилегающие к нему улицы оглашаются обрядовым пением муллы.